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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  36 lines
  1. ******************************************
  2. * Indoleamine 2,3-dioxygenase signatures *
  3. ******************************************
  4.  
  5. Indoleamine 2,3-dioxygenase  (EC 1.13.11.42)  (IDO) [1]  is an enzyme which is
  6. responsible for  the  conversion of tryptophan and other indole derivatives to
  7. kynurenines. In  mammals IDO is induced by interferon-gamma (IFN-gamma) and is
  8. responsible for some of its anti-proliferative effects. The degradative action
  9. of IDO  on  tryptophan leads to cell death by starvation of this essential and
  10. relatively scarce  amino  acid.  IDO  is a heme-containing enzyme of about 400
  11. amino acids.
  12.  
  13. The red muscle of the gastropod Sulculus  contains  an unusual myoglobin which
  14. is evolutionarily  related to IDO [2]; this  protein lacks  enzymatic activity
  15. but has kept its heme group.
  16.  
  17. As a signature for the IDO family we selected two conserved regions. The first
  18. is located  in the central section and is rich in glycine and serine residues;
  19. the second pattern is located in the second third of the sequence and contains
  20. a conserved histidine that could serve as a proximal ligand to the heme iron.
  21.  
  22. -Consensus pattern: G-G-S-A-[GA]-Q-S-S-x(2)-Q
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25.  
  26. -Consensus pattern: Y-M-x-P-A-H-[KR]
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  28. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  29.  
  30. -Last update: October 1993 / First entry.
  31.  
  32. [ 1] Taylor M.W., Feng G.S.
  33.      FASEB J. 5:2516-2522(1991).
  34. [ 2] Suzuki T., Takagi T.
  35.      J. Mol. Biol. 228:698-700(1992).
  36.